Režim ochrany obětí obchodování s lidmi a převaděčství je vymezen dvěma dalšími protokoly, které se týkají specifických oblastí: Protokol o prevenci, potlačování a trestání obchodování s lidmi (Protokol o obchodování s lidmi) a Protokol proti pašování migrantů po zemi, po moři a vzduchem (Protokol o pašování). 
Protokol o obchodování s lidmi, který vstoupil v platnost 25. prosince 2003, je hlavním mezinárodním právním nástrojem, který poskytuje konsensuální definici obchodování s lidmi. Vztahuje se na prevenci, vyšetřování a stíhání trestných činů uvedených v textu, pokud mají tyto trestné činy nadnárodní povahu a je do nich zapojena organizovaná zločinecká skupina. Cílem protokolu je rovněž chránit oběti těchto trestných činů a pomáhat jim při dodržování jejich práv a svobod a podporovat spolupráci mezi státy. Protokol trvá na tom, aby orgány uznaly oběť obchodování s lidmi a zacházely s ní jako s obětí, a nikoli jako s pachatelem trestného činu, bez ohledu na její správní status v cílové zemi.